Это детективная драма и напряженный психологический поединок между талантливым психиатром и пациентом с опасными наклонностями.

Успешный бизнесмен Владимир Нестеров (Даниил Страхов) одержим навязчивыми мыслями и обращается за анонимной помощью к талантливому психиатру Алексею (Кирилл Кяро), который гарантирует ему соблюдение закона о врачебной тайне, пока мысли пациента остаются только мыслями. В это же время пропадает маленькая дочь известного пианиста Константина Зобнина (Шамиль Хаматов), а следом находят тело второй девочки. Исчезновения девочек продолжаются… Психиатр подозревает Нестерова в убийствах и понимает, что не готов хранить «тайну исповеди». Он сообщает о Нестерове следователю СК (Михаил Тройник). Этот шаг становится роковым…

Каждый из героев этой полифонической истории одержим своим искушением, у каждого – свой «комплекс бога». История неумолимо движется к катастрофе, последствия которой придется устранять психиатру, чтобы самому разобраться, что на самом деле произошло и кто стоит за похищениями детей. И поможет ему в этом лучший друг пианиста Кости Зобнина — Бруно (Николай Шрайбер).

Сценарий сериала написала Алена Званцова, известная по своим режиссерским и сценарным работам «Частица Вселенной» с Викторией Исаковой, «Норвег» с Евгением Мироновым.

Режиссером-постановщиком «Комплекса бога» стала Флюза Фархшатова («О чем говорят мужчины: Продолжение», «Спроси Марту»).